Христофор Семенович Леденцов родился в Вологде в семье купца 1-й гильдии Семена Алексеевича Леденцова. Он окончил Вологодскую губернскую гимназию и Московскую практическую Академию коммерческих наук, получив личное почётное гражданство. После краткой стажировки в Кембридже Леденцов вернулся в Вологду и продолжил дело отца, занимаясь торговлей льном и пушниной, строительством доходных домов. Он значительно приумножил семейное состояние, основное богатство ему принесли акции железных дорог.

Леденцов был активным участником общественной жизни Вологды. Он был членом комитета Скулябинского дома призрения, директором этого дома призрения, мировым судьей Вологодского судебного округа, членом учетного комитета при Вологодском отделении Государственного банка, членом съезда мировых судей. В 1871-1887 годах он был гласным Вологодской городской Думы, а в 1883-1887 годах - городским головой Вологды. На посту городского головы Леденцов способствовал распространению на Вологодчине народных ремесел и промыслов, улучшил содержание заключенных в вологодской тюрьме.

Леденцов много путешествовал по Европе, был широко образован, знал восемь языков. У него была обширная библиотека в Вологде, насчитывавшая несколько тысяч томов научной и технической литературы. Он выделил значительные средства на развитие медицины, на его средства в Кривоколенном переулке были возведены несколько зданий, где разместили научно-исследовательские лаборатории. Леденцов также был учредителем Музея содействия труду и передал в дар Московскому отделению Императорского русского технического общества 50 тысяч рублей.

По духовному завещанию Леденцов оставил свой личный капитал на создание "Общества содействия успехам опытных наук и их практических применений". Общество было создано в 1909 году и просуществовало девять лет, включая 295 действительных и почетных членов, девять экспертных комиссий, библиотеку, и имело свой журнал. Активы общества были конфискованы декретами Советской власти в 1918 году. Леденцов скончался в 1907 году в Женеве от туберкулеза лёгких, его тело было перевезено в Вологду и предано земле на Введенском кладбище.